程序专利的申请可以按照以下步骤进行：
1. 提交申请：提交申请文件，如专利请求书、专利申请公开说明书等。
2. 受理申请：一旦专利申请文件提交后，专利局将予以受理并进行审查。如果经审查没有问题，专利局将自申请日起满十八个月即行公布。
3. 专利审查：发明专利申请后需进行初审和实质审查。审查员会对专利申请是否符合授权的条件进行详细的审查，并核对申请书中的各项信息是否符合规定。这一阶段可能会持续较长时间。
4. 授予专利权：若审查通过，申请人经过一系列的手续后即可领取专利证书和专利权保护证书，表明专利被正式授权，正式受到法律保护。需要注意的是，实用新型和外观设计专利通常只进行初步审查，发明专利则需要实质审查。对于涉及程序本身的专利申请，其关键在于程序是否足够创新并具备实用性。因此，在申请过程中应充分展示程序的特点和创新点。
具体的申请流程和所需材料可能会因国家或地区的不同有所差异。建议您咨询所在地的专利局或知识产权服务机构以获取详细的信息和帮助。
